呼吸（こきゅう）とは以下の二種類の意味がある。
- 細胞呼吸：細胞が最終電子受容体として酸素を用い、二酸化炭素(CO2)を放出する異化代謝系。内呼吸ともいう。
- 外呼吸：多細胞生物体が外界から酸素を取り入れ、体内で消費して二酸化炭素(CO2)を放出すること。
細胞呼吸については、広義には最終電子受容体として酸素を用いない『嫌気呼吸』もその意味合いに含まれるが、通例では呼吸とは酸素を用いる好気呼吸（こうきこきゅう）として用いる。
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